Pendidikan agama pada perguruan tinggi umum adalah masalah penting yang sudah sejak lama menarik perhatian banyak orang, termasuk kalangan Departemen Agama, khususnya Badan Litbang Agama. Sejak tahun 1966 pendidikan agama di Indonesia pada seluruh jenjang sekolah, termasuk pada perguruan tinggi telah memulai babak baru.